Life in soil by the actinorhizal root nodule endophyte Frankia

Frankia is a genus of soil actinomycetes famous for its ability to form N2-fixing root nodule symbioses with actinorhizal plants. Although Frankia strains diplay a high diversity in terms of ecological niches in soil, current knowledge about Frankia is dominated by its life as an endophyte in root nodules. Increased use of molecular methods has refined and expanded insights into endophyte-host specificities and Frankia phylogeny. This review has focus on Frankia as a soil organism, including its part of microbial consortia, and how to study Frankia in soil. We highlight the use of nodulation tests and molecular methods to reveal population size and genetic diversity of Frankia in soil and discuss how autoregulation of nodulation and interactions with other soil microorganisms may influence the results. A comprehensive record of published interactions between Frankia and other soil microbes is summarized

La ecología microbiana y la agricultura

El suelo es uno de los reservorios más grandes de biodiversidad en nuestro planeta. El suelo es un sistema vivo complejo y es el lugar donde se produce la transformación de la materia y el ciclo de los elementos químicos. El suelo regula la calidad del agua y del aire y sostiene el ciclo de los elementos y la transformación de la materia. Como consecuencia de todos estos servicios, el suelo beneficia la salud humana. La naturaleza del suelo cambia según sea el uso y manejo que se hace del suelo. La agricultura es un ejemplo de uso y manejo. Diferentes prácticas agrícolas generan diferentes cambios en la estructura biológica del suelo, a todas sus escalas y con diferentes consecuencias.Fil: Wall, Luis Gabriel. Universidad Nacional de Quilmes. Departamento de Ciencia y Tecnologia. Centro de Bioquimica y Microbiologia de Suelos. Laboratorio de Bioquimica y Biologia de Suelos.; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentin

Starting points in plant-bacteria nitrogen-fixing symbioses: intercellular invasion of the roots

Agricultural practices contribute to climate change by releasing greenhouse gases such as nitrous oxide that are mainly derived from nitrogen fertilizers. Therefore, understanding biological nitrogen fxation in farming systems is benefcial to agriculture and environmental preservation. In this context, a better grasp of nitrogen-fxing systems and nitrogen-fxing bacteria-plant associations will contribute to the optimization of these biological processes. Legumes and actinorhizal plants can engage in a symbiotic interaction with nitrogen-fxing rhizobia or actinomycetes, resulting in the formation of specialized root nodules. The legume-rhizobia interaction is mediated by a complex molecular signal exchange, where recognition of different bacterial determinants activates the nodulation program in the plant. To invade plants roots, bacteria follow different routes, which are determined by the host plant. Entrance via root hairs is probably the best understood. Alternatively, entry via intercellular invasion has been observed in many legumes. Although there are common features shared by intercellular infection mechanisms, differences are observed in the site of root invasion and bacterial spread on the cortex reaching and infecting a susceptible cell to form a nodule. This review focuses on intercellular bacterial invasion of roots observed in the Fabaceae and considers, within an evolutionary context, the different variants, distribution and molecular determinants involved. Intercellular invasion of actinorhizal plants and Parasponia is also discussed.Fil: Ibañez, Fernando Julio. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas, Fisicoquímicas y Naturales. Departamento de Ciencias Naturales; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba; ArgentinaFil: Wall, Luis Gabriel. Universidad Nacional de Quilmes; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Fabra, Adriana Isidora. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas, Fisicoquímicas y Naturales. Departamento de Ciencias Naturales; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba; Argentin

La asociación simbiótica de rizobios y leguminosas: estudios sobre las etapas tempranas de la preinfección

El estudio de la adsorción de Rhizobium meliloti a la superficie radicular de alfalfa permitió demostrar que la especificidad simbiótica ya se manifiesta e.. esta temprana etapa de la asociación (Caetano-Anollés y Favelukes 1986b). Lo que no se conoce aún, son los eventos moleculares involucrados en este proceso de adsorción y reconocimiento simbiótico. Con el objetivo de descubrir alguno de estos eventos moleculares, en esta tesis se estudiaron algunos factores que pudiesen estar involucrados en dicho proceso, en particular la participación del exudado radicular como determinante de la adsorción de Rhizobium meliloti a las raíces de alfalfa. Una vez establecida en el proceso de adsorción la existencia de una interacción entre el rizobio y el exudado radicular, se continuó el estudio de la misma. Se buscó establecer su significado dentro del proceso de la asociación simbiótica y se trató de caracterizar a los componentes del exudado radicular involucrados en dicha interacción.Tesis digitalizada en SEDICI gracias a la Biblioteca Central de la Facultad de Ciencias Exactas (UNLP).Facultad de Ciencias Exacta

Projeto Extensão "Panambi: Poesia para crianças"

O projeto Panambi: poesia para crianças busca a transformação dos sujeitos por meio da poesia, da leitura, da imaginação e da criatividade. Trata-se de continuação de um trabalho desenvolvido com a atuação e participação de uma série de pessoas tanto da comunidade acadêmica quanto externa, além do público-alvo de crianças e pré-adolescentes. Este ano de 2018, a ênfase recaiu sobre a poesia e a música, com a participação da bolsista Wall Assis até julho, e a continuidade se deu com a bolsista incorporada a partir desta data, Liliana Ester Zabaleta Rojas, que já participou como bolsista do projeto e atua no campo da difusão da cultura boliviana e da língua espanhola. Os resultados obtidos apontam para um interesse e sensibilização da(o)s envolvida(o)s com a música e a poesia, sendo que se tratam de duas artes ligadas desde o início, mas que foram separadas por áreas de estudo. Outro ponto forte do projeto é a perspectiva de formar leitores no campo da literatura, e, neste ano de 2018, de também introduzi-los no universo da escrita, utilizando-se de “poéticas da oralidade” que têm na performance o seu eixo norteador, buscando ampliar o diálogo interdisciplinar entre diferentes modalidades artísticas (literatura, música, teatro, dança, cinema, etc.) e despertando a criatividade e a curiosidade, além da reflexão e crítica sobre a criação em artes e poéticas

Selective enrichment of Pseudomonas spp. in the rhizoplane of different plant species

En contraste con la simbiosis entre rizobios y leguminosas, la especificidad de las pseudomonas en la colonización radicular parece menos estricta. Sin embargo, estudios sobre la diversidad bacteriana del nicho rizosférico resaltan la influencia de la especie vegetal en la selección específica de ciertos microorganismos a partir de la flora residente del suelo. Para evaluar el efecto que los cultivos extensivos de nuestro país tienen sobre la estructura de las comunidades de pseudomonas, se realizaron experimentos con plantas trampa, partiendo de semillas de trigo, maíz y soja, desinfectadas superficialmente y sembradas en un mismo suelo prístino. A partir de las suspensiones representativas de la microflora del rizoplano, se realizaron recuentos en placa en medio selectivo para pseudomonas. El conjunto de colonias de cada muestra se utilizó como fuente de ADN para analizar la estructura de comunidad a través del perfil de restricción de amplicones de los genes oprF y gacA. El análisis comparativo de estos perfiles agrupó a las muestras por especie de planta y las distinguió del patrón obtenido a partir del suelo prístino. La secuenciación parcial del gen 16S ADNr de aislamientos bacterianos representativos confirmó la existencia de genotipos enriquecidos diferencialmente en cada especie vegetal. Estos resultados apoyan la hipótesis de la existencia de mecanismos de selección específica de estirpes de pseudomonas a partir de la flora nativa del suelo en la interacción cooperativa entre estas PGPR y las raíces de diferentes cultivos como trigo, soja y maíz.In contrast to rhizobia-legume symbiosis, the specificity for root colonization by pseudomonads seems to be less strict. However, several studies about bacterial diversity in the rhizosphere highlight the influence of plant species on the selective enrichment of certain microorganisms from the bulk soil community. In order to evaluate the effect that different crops have on the structure of pseudomonad community on the root surface, we performed plant trap experiments, using surface-disinfected maize, wheat or soybean seeds that were sown in pots containing the same pristine soil as substrate. Rhizoplane suspensions were plated on a selective medium for Pseudomonas, and pooled colonies served as DNA source to carry out PCR-RFLP community structure analysis of the pseudomonads-specific marker genes oprF and gacA. PCR-RFLP profiles were grouped by plant species, and were distinguished from those of bulk soil samples. Partial sequencing of 16S rDNA genes of some representative colonies of Pseudomonas confirmed the selective enrichment of distinctive genotypes in the rhizoplane of each plant species. These results support the idea that the root systems of agricultural crops such as soybean, maize and wheat, select differential sets of pseudomonads from the native microbial repertoire inhabiting the bulk soil.Fil: Marrero, Mariana. Universidad Nacional de Quilmes. Departamento de Ciencia y Tecnología; ArgentinaFil: Agaras, Betina Cecilia. Universidad Nacional de Quilmes. Departamento de Ciencia y Tecnología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Wall, Luis Gabriel. Universidad Nacional de Quilmes. Departamento de Ciencia y Tecnología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Valverde, Claudio Fabián. Universidad Nacional de Quilmes. Departamento de Ciencia y Tecnología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentin

Draft genome sequence of <i>Burkholderia cordobensis</i> type strain LMG 27620, isolated from agricultural soils in Argentina

Bacteria of the genus Burkholderia are commonly found in diverse ecological niches in nature. We report here the draft genome sequence of Burkholderia cordobensis type strain LMG 27620, isolated from agricultural soil in Córdoba, Argentina. This strain harbors several genes involved in chitin utilization and phenol degradation, which make it an interesting candidate for biocontrol purposes and xenobiotic degradation in polluted environments.Instituto de Biotecnologia y Biologia Molecula

Draft genome sequence of <i>Burkholderia cordobensis</i> type strain LMG 27620, isolated from agricultural soils in Argentina

Bacteria of the genus Burkholderia are commonly found in diverse ecological niches in nature. We report here the draft genome sequence of Burkholderia cordobensis type strain LMG 27620, isolated from agricultural soil in Córdoba, Argentina. This strain harbors several genes involved in chitin utilization and phenol degradation, which make it an interesting candidate for biocontrol purposes and xenobiotic degradation in polluted environments.Instituto de Biotecnologia y Biologia Molecula

Draft genome sequence of <i>Burkholderia cordobensis</i> type strain LMG 27620, isolated from agricultural soils in Argentina

Bacteria of the genus Burkholderia are commonly found in diverse ecological niches in nature. We report here the draft genome sequence of Burkholderia cordobensis type strain LMG 27620, isolated from agricultural soil in Córdoba, Argentina. This strain harbors several genes involved in chitin utilization and phenol degradation, which make it an interesting candidate for biocontrol purposes and xenobiotic degradation in polluted environments.Instituto de Biotecnologia y Biologia Molecula